При некорректном завершении Windows, после перезагрузки компьютера появляется сообщение о необходимости проверки файловой системы на наличие ошибок с паузой 10 секунд до автоматического запуска проверки.

Время паузы (10 секунд по-умолчанию) корректируется в реестре Windows: в разделе реестра "HKEY_LOCAL_MACHINESYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager" необходимо создать параметр "DWORD" с именем "AutoChkTimeOut" и значением, которое Вам необходимо (максимальное значение 259200 секунд).

Также можно исключать диски из проверки с помощью параметра "BootExecute" в том же разделе реестра, например, исключаем диск E: "AutoCheck AutoChk /k:E *"